Carolina Curiqueo Roca
Santiago,CO
Summary
Soy bioquímica de formación y comencé mi carrera en laboratorio, especializándome en el diseño y producción de proteínas recombinantes. Con el tiempo, desarrollé un interés por bioinformática, lo que me llevó a cursar un diplomado y un magíster en la Universidad de Chile. Actualmente, me desempeño en el área de genómica, con experiencia en el análisis de datos transcriptómicos, tanto de RNA-seq como single-cell RNA-seq, así como en el estudio de comunidades microbianas mediante datos metagenomicos. Además, cuento con experiencia en la industria y la academia, destacándome por mis habilidades de trabajo en equipo y análisis de datos biológicos complejos.
Overview
5
5
years of professional experience
1
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Certification
Work History
Investigador Bioinformática
Universidad Andrés Bello
07.2024 - Current
Genómica
- Desarrollo e implementación de flujos de trabajo que permiten analizar comunidades microbianas presentes en datos de secuenciación 16S Nanopore e Illumina. Pipeline escritos en Python y Bash.
- Creación e indexación de nuevas bases de datos en clasificación taxonómica desde NCBI y GTDB.
- Análisis de expresión de genes presentes en datos metatranscriptomicos y transcriptomicos provenientes de RNA-seq.
Bioinformática estructural
- Estudio de la interacción de MAVS y NSs durante la infección de Andes virus mediante Docking molecular. En el marco de una colaboración con tesista de Doctorado UDD.
Protein Engineer
Protera Biosciences
03.2021 - 02.2024
- Producción y Purificación de proteínas recombinantes en organismos tales como, Saccharomyces cerevisiae, Escherichia coli y Pichia pastoris.
- Optimización de procesos de purificación y validación de candidatos mediante técnicas high-throughput.
- Implementación de métodos rápidos de detección de proteínas durante el screening de candidatos.
- Documentación de resultados en la plataforma Notion y presentación en reuniones del equipo y la compañia.
- Implementación de scripts ejecutables en Jupyter notebook, con el fin de mejorar el filtrado y búsqueda de una gran cantidad de datos asociados a experimentos con fluorimetria.
Asistente Investigación
Universidad De Santiago
11.2019 - 12.2021
- Producción de proteínas recombinantes en E. coli, S. cerevisiae y P. pastoris (PCR, RT PCR, clonación, transformación de cepas e inducción de la expresión de cDNA).
- Caracterización cinética de proteínas recombinantes.
- Caracterización bioquímica de proteínas recombinantes.
- Purificación por cromatografía de afinidad e intercambio iónico
Inmunoensayos Western blot. - Formulación de nueva generación de biofungicidas frente al hongo fitopatógeno Botrytis cinerea.
Education
Magíster En Bioquímica -
Universidad De Chile
Santiago12-2024
Bioquímica -
Universidad De Santiago
Santiago12-2018
Skills
- Trabajo en equipo
- Análisis de datos
- Diseño experimental
- Colección y organización de datos
- Escritura cientifica
Accomplishments
- Programación en lenguaje Python, Bash y R: Intermedio
- OS linux: Avanzado
- Protocolos en genómica: FastQC, Fastp, Dorado, STAR, Hisat2, DESEQ2, CellRanger, Dropseq tools, Bedtools, entre otros
- Protocolos en Estructural: Amber, Gromacs, Pymol, VMD, LightDock, Rosetta, PPIformer.
Certification
Diplomado en Bioinformática y Biología Computacional (2021), Universidad de Chile
Languages
English
Intermediate (B1)
Additional Information
Congresos:
- Presentación modalidad oral, "Optimización de un proceso de asignación taxonómica para secuencias 16S nanopore inspirado en EMU". XLVI Congreso Chileno de Microbiología (2024) Coquimbo, Chile.
- Presentación modalidad póster, "ARNs largos no codificantes como marcadores específicos de diferentes tipos celulares presentes en tejido vesícular humano", Sociedad Chilena de Bioinformática (2024) Concepción, Chile.
- Presentación modalidad póster, "Expresión del gen de la enzima mirosinasa de Brassica oleracea var. italica
mediante el sistema de autoselección en Saccharomyces cerevisiae", Sociedad Chilena de Biología y Ecología (2017) Puerto Varas, Chile
Publicaciones:
- Curiqueo, C., Mahn, A and Castillo, A (2022). Broccoli Myrosinase cDNA Expression in Escherichia coli and Saccharomyces cerevisiae. Biomolecules, 12(2), 233. https://doi.org/10.3390/biom12020233
Affiliations
- Centro de Bioinformática y Biología de sistemas, Universidad Andrés Bello
- ACCDIS, Universidad de Chile
Timeline
Investigador Bioinformática
Universidad Andrés Bello
07.2024 - Current
Protein Engineer
Protera Biosciences
03.2021 - 02.2024
Asistente Investigación
Universidad De Santiago
11.2019 - 12.2021
Diplomado en Bioinformática y Biología Computacional (2021), Universidad de Chile
Magíster En Bioquímica -
Universidad De Chile
Bioquímica -
Universidad De Santiago
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